秦始皇第五次出巡，东游的过程中，刚刚五十岁的秦始皇就突然暴病身亡。这让人倍感怀疑，因为秦始皇的身体状况一直不错，有什么根据呢？当年荆轲刺秦王失败，都说是荆轲没能耐，其实不然，燕太子丹最终能信任荆轲去刺秦王，就算功夫再差，这个人的胆识身手也不可能是一般人。荆轲图穷匕见，荆轲一剑刺去，秦王嬴政一回合拿下荆轲，可见秦王身手不错，反应快，身体矫健。包括后来高渐离也憋着心思想害死秦始皇:高渐离击筑，这就是当时的中国好声音，颇得嬴政喜爱。可是秦始皇也担心他有问题，就熏瞎了他的眼睛。高渐离就一天一天往筑里灌上铅，准备适时行凶。听力的敏锐高渐离通过耳朵准确判断秦始皇的位置，一下砸去，却也未能中伤沉迷于音乐中的秦始皇。可见秦始皇身体素质极佳。
出巡前又没有什么征兆，身体素质这么好的秦始皇，怎么会五十岁就死到半道上了呢？会不会是身边的防卫队出现问题了呢？张良为了报秦国灭韩国之仇，就在博浪这个地方派来一位大力士，准备干掉秦始皇。可当秦始皇的车队过来，却发现天子六乘（六匹马拉着）全部换为四乘，一时傻了眼，只能挑选最豪华的一个，结果车中根本不是秦始皇，行刺失败。怕死的人身边的防护就绝不会马虎，而且秦始皇也善于迷惑刺客，所以这个没有可能。
但是秦始皇为何出巡呢？不出巡是不是就不会死呢？在秦始皇出巡这一年，出现了三件事，让秦始皇倍感不舒心。一是荧惑守心。在今天看来不过是正常的天象，可在那时却意味着帝王不是退位就是死；二是陨石坠地，上书：始皇帝死而地分。虽然可能是竞争对手刻意设下的圈套，却被秦始皇当了一回事；三是沉璧事件：陌生人送来一块十年前秦始皇出巡祭奠水神投入河中的玉，并带话：今年祖龙死。祖龙即指最早那条龙，秦始皇。三个事件加在一起，让本来迷信的他有些担心，为保命就开始寻找方士术士谋求解决办法，得出结论——乘舟出海。
那么秦始皇是不是为了保命，听了方士术士的话，要将出巡达到一定里程，在路上周折奔波而死了呢？前面提到，秦始皇是个身手矫健的人，如果不是平时注重锻炼也不可能达到这个程度，可见也没有这个可能。
那么是不是真的病死了呢？史书说其长相：蜂准、长目、挚鸟膺、豺声。也就是高鼻梁、大眼睛、鸡胸、说话痰嗓。推测其易患呼吸道疾病，伴着舟车劳顿，感染细菌，最后暴病身亡。但是痰嗓也不过是像汪峰一般的嗓音，这也不能足以证明他就是患了支气管炎而死呀。这种推理也不足为证。
中毒身亡？那时的秦始皇为长生不老吃仙丹，那时的仙丹大多为汞水银制作。但是中毒前应该有征兆，至少身体有反应。这些只有在开墓后才能知道真相。
之后历史学家郭沫若提出论断：秦始皇死时，赵高李斯发现秦始皇耳朵里有个大长钉子钉进脑子里。能满足这样的条件的人，只有其第十八子胡亥，为什么要这么说呢？秦始皇时期，不立太子，不立皇后。晚年想安排公子扶苏接过手中的千秋大业，如此最受皇帝喜爱的十八子胡亥就成了最大的受害者。于是只有害死秦始皇，假传圣旨，才能登上王位。史实上，胡亥登基后，也确实毒死了公子扶苏一党。不过这也有待开棺之后才能验明真相。
